Parameters and genetic trends for reproductive characteristics of a closed Angus herd / Parámetros y tendencias genéticas de características reprodutivas de um rebaño cerrado Angus / Parâmetros e tendências de carcaterísticas reprodutivas de um rebanho fechado Angus

Abstract Background: Closed breeding populations are useful to conduct basic and applied research. The Wye Angus herd is one of them. It was founded using only a few animals. The pedigree of the descendants of the original herd can be completely described by historical records resulting from strong selection. Wye Angus genetics has influenced that of Aberdeen Angus, Red Angus, and Brangus cattle worldwide. Objective: To evaluate parameters and genetic trends associated with the reproduction traits of the Wye Angus herd between the years 1937 and 2012. Methods: We used pedigree information of 11,692 individuals. The reproductive traits assessed were age at first calving (AFC), calving interval (CI), and scrotal circumference (SC). The covariance components were estimated by Bayesian inference. The genetic trends were obtained by linear regression of the genetic values over birth years of the animals. Results: The heritability estimates for AFC, and CI were negligible, although a small genetic gain was associated with CI. Because the AFC and CI values of the herd are small, past reproductive management has produced favourable results for the heifers. Conclusion: The Wye Angus herd has enough genetic variability for genetic gain through selection on SC.

Resumen Antecedentes: Las poblaciones reproductivas cerradas son útiles para realizar investigacion básica y aplicada. El hato Wye Angus es uno de ellos. Fue fundado utilizando sólo unos pocos animales. El pedigrí de los descendientes del hato original puede describirse completamente mediante registros históricos resultantes de una fuerte selección. La genética del Wye Angus ha influido en la del Aberdeen Angus, Red Angus y Brangus en todo el mundo. Objetivo: Evaluar los parámetros y las tendencias genéticas de características reproductivas del rebaño Wye Angus en el periodo entre 1937 y 2012. Métodos: Utilizamos información de pedigrí de 11.692 individuos. Las características evaluadas fueron circunferencia escrotal (SC), edad al primer parto (AFC) y el intervalo entre partos (CI). Los componentes de (co)variancia fueron obtenidos mediante metodología Bayesiana. Las tendencias genéticas fueron obtenidas por regresión lineal ponderada de los valores genéticos sobre el año de nacimiento del animal. Resultados: Las estimaciones de heredabilidad para AFC y CI fueron insignificantes, aunque se asoció un pequeño beneficio genético con CI. Sin embargo, la AFC y el CI del rebaño son bajos, indicando que el manejo reproductivo ha traído resultados favorables para las novillas. Conclusion: El rebaño Wye Angus posee suficiente variabilidad genética para la ganancia genética por medio de la selección para SC.

Resumo Antecedentes: O rebanho Wye Angus foi fundado a partir de poucos animais e destaca-se por ser um rebanho fechado, com informações completas de pedigree e forte seleção, oferecendo vantagens únicas em termos de realização de pesquisas em melhoramento genético animal. Além disso, a genética de Wye Angus tem influenciado os de Aberdeen Angus, Red Angus e Brangus em todo o mundo. Objetivo: Avaliar os parâmetros genéticos e tendências de características reprodutivas do rebanho Wye Angus no período entre 1937 e 2012. Métodos: Foram usadas informações do pedigree de 11.692 individuos. As características avaliadas foram: perímetro escrotal (SC), idade ao primeiro parto (AFC), e do intervalo entre partos (CI). Componentes de (co) variância foram obtidos por meio da metodologia Bayesiana. As tendências genéticas foram obtidas por regressão linear ponderada dos valores genéticos sobre o ano de nascimento do animal. Resultados: Hereditariedade para AFC e CI foram insignificantes, embora um pequeno ganho genético tenha sido associado a CI. No entanto, os valores para AFC e CI do rebanho são baixos, indicando que o manejo reprodutivo trouxe resultados favoráveis para as novilhas. Conclusão: O rebanho Wye Angus tem variabilidade genética suficiente para ganho genético através de seleção para SC.

Genetic parameters and trends for litter size in Markhoz goats / Parámetros genéticos y tendencias para el tamaño de la camada en cabras Markhoz / Parâmetros genéticos e tendências para o tamanho da ninhada em cabras Markhoz

Abstract Background: Prolificacy has a high economic value and is one of the most important reproduction traits in small ruminants such as Markhoz goats, which is an endangered breed. Objective: To estimate genetic, environmental and phenotypic trends, and genetic parameters for litter size (LS), as a prolificacy trait of Markhoz goat does. Methods: The study was conducted using kidding records of 3,064 Markhoz does from 1992 to 2015. Genetic parameters were estimated with a logit link function using ASReml software, fitting a repeatability animal model, with birth year, kidding year, and kidding age as fixed effects, and direct additive genetic and permanent environmental effects as random effects. Genetic, phenotypic and environmental trends were estimated by using regression of breeding value, phenotypic value and environmental deviation averages on birth year, respectively. Results: Low and negligible heritability (0.002), repeatability (0.054) and coefficient of permanent environment (0.052) were estimated for LS, which indicates low possibility to achieve rapid genetic progress through phenotypic selection. A non-significant -actually, zero- genetic trend (0.00004 heads/kidding/year), and significant negative phenotypic and environmental trends (-0.01097 and -0.01100 heads/kidding/year, respectively) were estimated in this study. Conclusion: Optimizing environmental conditions and application of high-throughput technologies in selection programs could help reducing the extinction risk of Markhoz breed.

Resumen Antecedentes: La prolificidad tiene un alto valor económico y es uno de los rasgos reproductivos más importantes en pequeños rumiantes, tales como la raza caprina Markhoz. que está en peligro de extinción. Objetivo: Estimar las tendencias genéticas, ambientales y fenotípicas, y los parámetros genéticos para el tamaño de la camada (LS), como rasgo de prolificidad de las hembras de cabras Markhoz. Métodos: Se utilizaron registros de partos de 3.064 hembras Markhoz, de 1992 a 2015. Los parámetros genéticos se estimaron con una función de enlace logit utilizando el software ASReml, ajustando un modelo animal de repetibilidad, con el año de nacimiento, el año del parto y la edad al parto como efectos fijos, y genéticos aditivos directos y efectos ambientales permanentes como efectos aleatorios. Las tendencias genéticas, fenotípicas y ambientales se estimaron mediante la regresión del valor de la cría, el valor fenotípico y los promedios de desviación ambiental en el año de nacimiento, respectivamente. Resultados: Se estimó la heredabilidad -baja e insignificante- (0,002), repetibilidad (0,054) y coeficiente de ambiente permanente (0,052) para LS, lo que indica una baja posibilidad de lograr un progreso genético rápido a través de selección fenotípica. Se estimó una tendencia genética no significativa -de hecho, cero- (0,00004 cabezas/parto/año) y se estimaron tendencias fenotípicas y ambientales negativas significativas (-0,01097 y -0,01100 cabezas/parto/año, respectivamente) en el período estudiado. Conclusión: La optimización de las condiciones ambientales y la aplicación de tecnologías de alto rendimiento en los programas de selección podrían reducir el riesgo de extinción de la raza Markhoz.

Resumo Antecedentes: A prolificidade tem um elevado valor económico e é uma das mais importantes características de reprodução nos pequenos ruminantes, como a raça de caprinos Markhoz, que está em perigo de extinção. Objetivo: Estimar tendências genéticas, ambientais e fenotípicas, e parâmetros genéticos para o tamanho da serapilheira (LS), como um traço de proliferação de cabras Markhoz. Métodos: Este estudo foi realizado usando registros de parto de 3.064 Markhoz entre 1992 e 2015. Os parâmetros genéticos foram estimados com uma função logit link utilizando o software ASReml, ajustando um modelo animal de repetibilidade, com o ano de nascimento, o ano de parto ea idade de caçoar como efeitos fixos e efeitos ambientais diretos e genéticos diretos como efeitos aleatórios. As tendências genéticas, fenotípicas e ambientais foram estimadas pela regressão do valor de criação, valor fenotípico e médias de desvio ambiental no ano de nascimento, respectivamente. Resultados: Herdabilidade baixa e negligenciável (0,002), repetibilidade (0,054) e coeficiente de ambiente permanente (0,052) foram estimadas para LS, o que indica baixa possibilidade de alcançar um progresso genético rápido através da seleção fenotípica. Foi estimada uma tendência genética não-significativa e realmente zero (0,00004 cabeças/parto/ano) e tendências fenotípicas e ambientais negativas significativas (-0,01097 e -0,01100 cabeças/parto/ano, respectivamente) no período estudado. Conclusão: Parece que a otimização das condições ambientais ea aplicação de tecnologias de alto rendimento em programas de seleção poderiam reduzir o risco de extinção para a raça Markhoz.

Comparación del ordenamiento de predicciones BLUP y la respuesta a la selección en conejos cuando el efecto año-estación se considera fijo o aleatorio / Comparison of the BLUP prediction order and the response to selection in rabbits when the effect yearseason is considered to be either fixed or random

En lineas de conejos reproductivamente cerradas, criadas con generaciones discretas, existe una fuerte asociacion entre el año-estacion (AE) y los niveles de consanguinidad (F). Estudios realizados anteriormente mostraron que, cuando AE y F son considerados como efectos fijos en un modelo, la heredabilidad y la tendencia genetica se sobreestiman. El objetivo del trabajo fue investigar las consecuencias de considerar AE como fijo (M1) o aleatorio (M2) sobre la seleccion de animales. Se utilizaron 15671 registros correspondientes al numero de destetados de la linea A, del Departamento de Ciencia Animal de la Universidad Politecnica de Valencia, España. Los modelos fueron comparados en base a: los ordenamientos de los valores geneticos aditivos estimados en cada generacion y la respuesta esperada a la seleccion. Se plantearon seis escenarios segun intensidades de seleccion. En cada uno se estimo la correlacion de Spearman y se calculo el porcentaje de discordancia (D) entre los animales elegidos por M2 y no por M1. La respuesta a la seleccion para los animales escogidos por M1 o M2, fue estimada como la pendiente de la recta de regresion entre las medias de los valores geneticos predichos por M2 a traves de las generaciones. A medida que disminuyo la presion de seleccion, aumentaron las correlaciones de Spearman, disminuyendo los D. Aunque, a nivel generacion ambos estimadores no mantuvieron siempre la misma relacion. Las respuestas a la seleccion estimadas fueron similares para los animales seleccionados por M1 o M2, con lo cual no se esperan diferencias entre ambos modelos respecto a la seleccion.

In close reproductive lines of rabbits reared in discrete generations, there is a strong association between the year-season (AE) and the levels of consanguinity (F). Previous studies have shown that when AE and F were considered as fixed effects in a model, the heritability and the genetic tendency were overestimated. The objective of this work was to investigate the consequences of considering AE as either a fixed (M1) or random (M2) effect on the selection of animals. A total of 15,671 records corresponding to the number of rabbits weaned in line A, from the Department of Animal Science of the Polytechnic University of Valencia, Spain, were used. The comparison of models was based on the rankings of the estimated additive genetic values in each generation and the expected response to the selection. Six scenarios were proposed, varying in selection intensities. In each one, the Spearman correlation was estimated and the percentage of discordance (D) between the animals chosen for M2 but not for M1 was calculated. The response to selection for the animals chosen by either M1 or M2, was estimated as the slope of the regression line between the means of the genetic values predicted by M2 through generations. As the selection pressure decreased, the Spearman correlations increased, decreasing the D. However, at the generation level, both estimators did not always maintain that relationship. The estimated responses to selection were similar when the selection was based on estimated breeding values obtained by using either M1 or M2. Therefore, no differences are expected between both models with respect to selection.

Avaliação genética de caprinos da raça Saanen nascidos no Brasil de 1979 a 2009 / Genetic evaluation of Saanen goats born in Brazil from 1979 to 2009

O objetivo deste trabalho foi estimar herdabilidades, correlações genéticas e fenotípicas e tendências genéticas das características morfológicas e de tipo de caprinos da raça Saanen nascidos no Brasil de 1979 a 2009. Dados de 1243 caprinos, 197 machos e 1046 fêmeas, foram utilizados para estimar parâmetros genéticos e tendência das características: perímetro torácico, comprimento corporal, altura na cernelha, altura, largura e comprimento da garupa, bem como as principais características que definem o padrão racial e a aptidão do animal (paleta e linha superior, membros e pés, tipo leiteiro, capacidade de corpo, úbere, ligamento traseiro e dianteiro, textura do úbere, tetos e nota). Os componentes de variância foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita em análise multicaracterística. A tendência genética foi obtida por meio da regressão dos valores genéticos médios por ano de nascimento. As estimativas de herdabilidade das características morfofuncionais variaram de 0,08 a 0,45, as correlações genéticas de -0,58 a 0,89 e fenotípicas de -0,11 a 0,87. A tendência foi de um leve declínio ao longo dos anos para a maior parte das características avaliadas, o que evidencia a existência de variabilidade genética aditiva entre os animais, mas demonstra que a seleção praticada tem sido pouco efetiva...

The aim of this study was to estimate heritability, genetic and phenotypic correlations and genetic trends of morphological characteristics and type of Saanen goats born in Brazil from 1979 to 2009. Data from 1243 goats, 197 males and 1046 females were used to estimate genetic parameters and trends for the following traits: girth, body length, wither height, height, width and rump length, and the main traits that define the breed standard and ability of the animal (shoulder and topline, limbs and feet, dairy type, body capacity, mammary gland, linking front and rear, texture of the udder, teats and note). Variance components were estimated by Restricted Maximum Likelihood multi-trait analysis. Genetic trends were obtained by regression of mean breeding values by year of birth. The heritability estimates of morphological and functional traits ranged from 0.08 to 0.45, the genetic correlations from -0.58 to 0.89 and phenotypes from -0.11 to 0.87. The trend was a slight decline over the years for most traits, which shows the existence of additive genetic variability among animals, but it demonstrates that the selection practiced has been ineffective...

Avaliação genética para peso corporal em um rebanho Nelore / Genetic evaluation for body weight in a Nellore herd

Estimaram-se as herdabilidades para os efeitos genéticos direto e materno e as correlações genéticas entre essas variáveis para os pesos ao desmame (P205), ao ano (P365) e ao sobreano (P550) em um rebanho Nelore do norte de Minas Gerais. O modelo estatístico incluiu os efeitos aditivos direto e materno, os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (fazenda, sexo, regime alimentar, estação (seca e água) e ano de nascimento do animal) e o efeito da covariável idade da vaca ao parto (linear e quadrático). Os componentes de variância e os valores genéticos foram estimados utilizando-se o método REML. A tendência genética foi obtida utilizando-se a regressão do valor genético médio anual em relação ao ano de nascimento dos animais. As estimativas de herdabilidade do efeito aditivo direto () para P205, P365 e P550 foram 0,60, 0,69 e 0,75, respectivamente. Estes coeficientes de são de alta magnitude, indicando que o rebanho apresenta variabilidade genética aditiva relativa e, portanto, espera-se progresso genético considerável utilizando a seleção. Pela análise da tendência genética, verificou-se que houve evolução nos valores genéticos dos animais ao longo dos anos estudados.

The heritabilities for direct and maternal genetic effects and genetic correlations between these effects were estimated for weight at 205 (P205), 365 (P365), and 550 days (P550) in a Nelore herd in northern Minas Gerais. The statistical model included direct and maternal additive effects, in addition to the fixed effects of contemporary group (farm, gender, diet, season - dry and water -, and year of birth) and the covariate age of cow at calving (linear and quadratic effects). The variance components and genetic values were estimated by REML method. The genetic trend was obtained using the regression of the annual mean genetic value in relation to the year birth. The heritability estimates for the direct additive effect () for P205, P365, and P550 were equal to 0.60, 0.69, and 0.75, respectively. These coefficients showed high magnitude, indicating that the herd in question presents a great additive genetic variability and therefore it is expected a great progress using genetic selection. By the analysis of genetic trend, it was verified a development in animals genetic values over the years studied.

History of registered Gyr breed in Brazilian Northeast: population structure and genetic improvement of growth traits / Histórico da raça Gir registrada no Nordeste brasileiro: melhoramento genético em características de crescimento e estrutura populacional

This paper provides an evaluation of the population structure, phenotype and genetic trends of registered Gyr herd cattle in northeast Brazil. The study provides important baseline information for the management, conservation and potential population expansion of this economically and culturally important cattle breed. Pedigree data were analyzed for individuals born between 1964 and 2006. Body weight values were adjusted to 205 and 365 days of age for animals born between 1978 and 2006. Phenotypic change of zebu Gyr in northeast Brazil is solely due to environmental improvement. However, there is potential for artificial selection for weight gain in young cattle. Effective population size decreased during the 1990s and the average inbreeding coefficient increased during the studied period. An increase of the effective population size of Gyr in northeast Brazil is strongly recommended, along with an increase in the management of the mating process to prevent inbreeding and to maintain the genetic variability of the breed.

Com o intuito de fornecer subsídios para programas de conservação, seleção e expansão da raça Gir no Nordeste do Brasil, objetivou-se avaliar o histórico do rebanho Gir registrado no nordeste brasileiro, com base na sua estrutura populacional e no progresso genético e fenotípico de características de desenvolvimento ponderal. Foram utilizadas informações de pedigree de animais nascidos no período de 1964 a 2006 e dados dos pesos ajustados aos 205 e 365 dias de idade de bovinos nascidos de 1978 a 2006. O progresso genético para a raça no Nordeste foi ocasionado exclusivamente pelo melhoramento ambiental. O tamanho efetivo da população reduziu a partir da década de 90, e o coeficiente de endogamia médio aumentou durante o período estudado. É imprescindível que o tamanho efetivo da raça Gir do nordeste seja ampliado e que haja maior controle de acasalamentos entre indivíduos aparentados, para prevenção da endogamia e conservação da variabilidade genética e viabilidade da raça.